La ausencia de Bolívar por varios períodos, en los que se encontraba luchando por la Liberación del Sur.
El territorio era muy extenso y se dificultaba la comunicación
Los caudillos locales estaban en desacuerdo con el liderazgo de Bogotá
La existencia de sectores políticos que no estaban de acuerdo con la integración
Los venezolanos querían mayor autonomía en su territorio.
Los estragos causados durante la Guerra de Independencia dejaron al país prácticamente arruinado.
La producción y el comercio estaban paralizados por la Guerra Independentista
La oligarquía desde un comienzo se opuso a la Constitución de Cúcuta, por medio de la prensa y de las Municipalidades.
Sus habitantes no llegaron a sentirse nunca colombianos.
Las diferencias existentes entre las costumbres, intereses y carácter de las poblaciones.