En sectores del desierto costero se encuentran especies tales como el guanaco, zorro culpeo, chilla, lobo de mar y numerosas gaviotas y pelícanos.
La fauna de la zona de archipiélagos y fiordos es poca, destacando las escasas poblaciones de huemul. En los bosques se pueden hallar avescomo los chucaos y el martín pescador.
En la zona costera destacan mamíferos como el monito del monte, el murciélago colorado, la lauchita colilarga de las espinas, el ratón topo y pudú, entre otros.
NORTE GRANDE
ZONA CENTRAL
ZONA AUSTRAL
ZONA SUR
Se puede encontrar un gran número de especies introducidas, muchas de las cuales son consideradas como plagas. como es el caso del conejo, el guaren, la cotorra argentina, la rana africana y la chaqueta amarilla, entre otras.
NORTE CHICO
Las especies más típicas de mamíferos son: guanaco, vicuña, llama, aloaca, taruca, vizcacha, zorro culpeo, zorro chilla, zorro gris y lauchón orejudo.
